اهم فعالیت‌های مرکز:

- راه اندازی شبکه ایمونولوژی پایه و بالینی کشور
- تشکیل شورای سیاست‌گذاری علمی- آموزشی
- راه اندازی کمیسیون‌های تخصصی با همکاری استادان و محققان مربوط
- راه اندازی کمیته پیوند سلول‌های بنیادی (مغز استخوان) بیماران نقص ایمنی اولیه با همکاری مرکز تحقیقات هماتولوژی و پیوند سلول‌های بنیادی
- تشکیل کمیته اخلاق
-  انجام تست‌های تشخیصی، تخصصی و فوق‌تخصصی بیماری‌های نقص ایمنی اولیه
-  اندازه‌گیری IgE اختصاصی با روش‌های Immunocap و RIDA Allergy  Screen و ...
- تشکیل درمانگاه ویژه و ویزیت بیماران ارجاع شده از سراسر کشور
- ارائه مشاوره ژنتیک توسط متخصص ژنتیک
-راه‌اندازی بانک‌های اطلاعاتی بیماران مبتلا به آسم، رینیت آلرژیک،
آلرژی غذایی، آنافیلاکسی، نقص ایمنی اولیه، آنژیوادم ارثی
- تأسیس بانک DNA مخصوص بیماران مبتلا به آسم، نقص ایمنی
اولیه و آلرژی در بانک ذخایر ژنتیکی و زیستی(DNA، سلول و سرم)
- تشخیص ژنتیک بیماری‌های نقص ایمنی اولیه قبل و بعد از تولد
- جذب دانشجوی PhD by Research
- جذب دانشجویان خارجی در دوره های کوتاه مدت و مقطع PhD
- برگزاری دوره‌های آموزشی، پژوهشی و علمی برای دانشجویان مقطع
کارشناسی ارشد و دکترا
- اجرای طرح های بین المللی با مشارکت مراکز تحقیقاتی کشورهای:
آلمان، سوئد، مجارستان، فرانسه، ایتالیا و ...
تشکیل صندوق کمک به بیماران نقص ایمنی اولیه